Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTTNQ14247 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms