Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCOA4Q13772 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms