Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTMR3Q13615 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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