Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME3Q13232 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME3Q13232 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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NME3Q13232 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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NME3Q13232 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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NME3Q13232 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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