Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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STRN3Q13033 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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STRN3Q13033 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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STRN3Q13033 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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STRN3Q13033 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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STRN3Q13033 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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STRN3Q13033 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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