Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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