Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXF1Q12946 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FOXF1Q12946 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FOXF1Q12946 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FOXF1Q12946 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FOXF1Q12946 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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