Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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FOXO1Q12778 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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FOXO1Q12778 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXO1Q12778 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXO1Q12778 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXO1Q12778 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXO1Q12778 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXO1Q12778 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXO1Q12778 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXO1Q12778 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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