Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXCL9Q07325 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms