Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG1Q06432 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms