Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XPCQ01831 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms