Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms