Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK16Q00536 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms