Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HTRA4P83105 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms