Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113P63132 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113P63132 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113P63132 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63132 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63132 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63132 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63132 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63132 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63132 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63132 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63132 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63132 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms