Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPL23P62829 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPL23P62829 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPL23P62829 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPL23P62829 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPL23P62829 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPL23P62829 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPL23P62829 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPL23P62829 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPL23P62829 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms