Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SMARCA2P51531 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA2P51531 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms