Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE6CP51160 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms