Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSEN1P49768 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms