Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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