Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPFP49454 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPFP49454 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPFP49454 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPFP49454 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CENPFP49454 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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CENPFP49454 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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CENPFP49454 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CENPFP49454 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPFP49454 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPFP49454 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPFP49454 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CENPFP49454 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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