Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBRP36941 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBRP36941 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBRP36941 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms