Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNB1P20700 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms