Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms