Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ESR1P03372 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ESR1P03372 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms