Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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