Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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