Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
O00370 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
O00370 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
O00370 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
O00370 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
O00370 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
O00370 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
O00370 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
O00370 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
O00370 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
O00370 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
O00370 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
O00370 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
O00370 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
O00370 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
O00370 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms