Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOBPA7XYQ1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms