Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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HDGFL3Q9Y3E1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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