Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIMKLBQ9ULI2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIMKLBQ9ULI2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms