Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GIN1Q9NXP7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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