Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMBRD1Q9NUN5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms