Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB6BQ9NRW1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms