Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC39A8Q9C0K1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms