Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD11Q9BXL7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms