Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TINF2Q9BSI4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TINF2Q9BSI4 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms