Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBBP8Q99708 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms