Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms