Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SIN3AQ96ST3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3AQ96ST3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms