Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms