Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUB2Q96DC9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms