Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms