Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-CQ95604 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms