Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms