Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms