Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SV2AQ7L0J3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms