Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC141Q6ZP82 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms