Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF123Q5XPI4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF123Q5XPI4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF123Q5XPI4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF123Q5XPI4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms