Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms